Нужно настроить разделитель учета. Точнее необходимо некоторые счета (все что связано с НДС) разбить на два (экспорт и внутренний рынок). Разделить учет вроде бы получилось (настроила сортировку по разделителю учета), все отчеты разделяются, но в балансе как было все вместе так и осталось. Добавить дополнительные счета (например 68.2.1 и 68.2.2) не помогает.